Specie semi-terrestre, vive in gruppi composti mediamente da 40 individui (possono arrivare ben oltre i centocinquanta) guidati da un maschio dominante, il cosiddetto alpha. Nel gruppo si instaurano forti legami sociali che vengono mantenuti saldi dalla pulizia reciproca del pelo (grooming). Questa pratica, infatti, oltre a liberare il pelo dai parassiti, rappresenta una sicurezza nel mantenimento delle relazioni reciproche. Il macaco del Giappone è anche un ottimo nuotatore.